Ebben a laboratóriumban üzemel a MedInProt pályázat keretében elnyert gélelektroforézis és Western blot készülék. A készülékegyüttes alkalmas arra, hogy a sejtekben (pl. tumorsejtek) lejátszódó fehérje szintű változásokat nyomonkövessük. Megállapítható segítségükkel, hogy a sejtek milyen receptorkészlettel rendelkeznek és ezek hogy változnak a peptidkonjugátumokkal való kezelés hatására. Továbbá vizsgálhatók a sejten belüli jelátviteli folyamatokban résztvevő fehérjék mennyiségének változásai a kezelések hatására.